R语言绘制一次和二次相关性热图

作品简介

在数据探索的过程中,我们往往会对数据与数据的相关性进行分析,例如我们常用的corrplot包,或者psych包中的corr.test函数,对两两变量间的相关性进行分析。我们常常会看到这样的相关性热图:


但有时变量间的关系并非线性,例如:我们熟知的微生物物种多样性与土壤pH之间的关系。因此在数据探索过程中,仅使用线性相关会导致我们遗漏一些重要信息。二次关系也需要纳入我们考虑的范围,因此本资源将对两两变量的二次关系的R代码及可视化进行介绍,助力数据探索。

我们尝试在对数据进行线性相关分析的同时,加入二次关系的分析,数据的可视化显示的结果大致如下:其中菱形表示线性相关显著,圆圈表示线性相关不显著,而二次关系显著。


可视化代码遵循如下原则:

  1. 若线性相关性显著,无论二次关系是否显著,均使用线性相关的R值和P值;(使用最简单的模型)
  2. 若线性相关性不显著,则查看二次关系是否显著,若显著则显示二次关系的R值和P值;若不显著则均不显示。

资源内容包括测试数据和可视化代码。

创作时间:2024-04-11 17:21:36